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中草藥具有天然性、多能性、毒副作用和殘留小、細菌對中草藥不易產生耐藥性等優點。多年來，水產養殖生產中采用水中浸泡、飼料中加入等方法，進行疾病預防和治療，取得了顯著的效果。對有效的中草藥及其配方，為了取得精品，需分離和提取有效成分，提取、分離和純化方法如下：

溶劑提取法

浸提法 將藥粉加入適當溶劑，經多次攪拌振搖稀濾過，濃縮后可得到提取物。

滲漉法 將藥粉和溶劑裝入滲漉筒中，然后不斷加新溶劑，收集提取液即可。

煎煮法 將藥粉加水煮沸、濾過即可。

回流提取法 如用有機溶劑加熱提取時，需用回流加熱裝置，以免溶劑揮發，經1小時兩次以上的回流后，濾出提取液，并經蒸餾回收溶劑后取得濃縮提取物。

連續提取法 為了彌補回流提取法需溶劑量大的不足，用連續回流裝置進行提取。

中草藥成分的分離和純化

系統溶劑分離法 通常由親脂性到親水性次序組成溶劑系統，依次提取藥粉中的不同成分。

兩相溶劑萃取法 利用兩種溶劑的比重不同自然分層和分散相液滴穿過連續相溶劑時發生傳遞萃取的方法。

沉淀法 在提取液中加入某些試劑(如鉛鹽、苦味酸、氫氧化銅、氯化鈣和石灰等)使之發生沉淀，以獲取有效成分的方法。

鹽析法 在提取液中加入無機鹽(氯化鈉、硫酸鈉等)至一定濃度或飽和態，使某些成分在水中溶解度降低而沉淀析出的方法。

結晶法 利用混合物在溶劑中溶解度不同進行分離的方法。

透析法 是指利用小分子及小離子在溶液中可通過半透膜的性質，借以達到分離的方法。

升華法 利用固體物受熱在低于其熔點的溫度下，其可不經溶化而直接轉化為蒸氣，并在遇冷后蒸氣又凝結為固體的特性，進行純化藥品的方法。

分餾法 利用多次反復蒸餾，以達到混合物分離的方法。

層析法(色層法、色譜法)

根據藥物不同類和性質，而選用吸附層析、交換層析、分層層析、凝膠析、柱層析等方法。